Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfrO88507 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfrO88507 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfrO88507 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfrO88507 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfrO88507 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfrO88507 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfrO88507 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfrO88507 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntfrO88507 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntfrO88507 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntfrO88507 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntfrO88507 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms