Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cfdp1O88271 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms