Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm10509O88255 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm10509O88255 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm10509O88255 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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