Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChkbO55229 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkbO55229 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkbO55229 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChkbO55229 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms