Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtogO55225 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtogO55225 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtogO55225 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtogO55225 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtogO55225 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtogO55225 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtogO55225 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtogO55225 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtogO55225 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtogO55225 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtogO55225 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtogO55225 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtogO55225 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtogO55225 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtogO55225 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtogO55225 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtogO55225 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtogO55225 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtogO55225 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
OtogO55225 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtogO55225 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtogO55225 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtogO55225 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtogO55225 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtogO55225 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtogO55225 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtogO55225 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtogO55225 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtogO55225 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OtogO55225 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtogO55225 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtogO55225 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtogO55225 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtogO55225 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtogO55225 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OtogO55225 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtogO55225 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtogO55225 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtogO55225 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtogO55225 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtogO55225 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtogO55225 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OtogO55225 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OtogO55225 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OtogO55225 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OtogO55225 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OtogO55225 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OtogO55225 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OtogO55225 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OtogO55225 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OtogO55225 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OtogO55225 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OtogO55225 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OtogO55225 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OtogO55225 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OtogO55225 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OtogO55225 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OtogO55225 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OtogO55225 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OtogO55225 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OtogO55225 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OtogO55225 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OtogO55225 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OtogO55225 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OtogO55225 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OtogO55225 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OtogO55225 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OtogO55225 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OtogO55225 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OtogO55225 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OtogO55225 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OtogO55225 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OtogO55225 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OtogO55225 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OtogO55225 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OtogO55225 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OtogO55225 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OtogO55225 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OtogO55225 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OtogO55225 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OtogO55225 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OtogO55225 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OtogO55225 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OtogO55225 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.4 ms