Protein–RNA interactions for Protein: O55137

Acot1, Acyl-coenzyme A thioesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot1O55137 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acot1O55137 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acot1O55137 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acot1O55137 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot1O55137 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot1O55137 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot1O55137 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot1O55137 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acot1O55137 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acot1O55137 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Acot1O55137 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot1O55137 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot1O55137 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot1O55137 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot1O55137 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Acot1O55137 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot1O55137 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot1O55137 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot1O55137 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot1O55137 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Acot1O55137 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Acot1O55137 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot1O55137 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot1O55137 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot1O55137 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot1O55137 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot1O55137 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot1O55137 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot1O55137 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot1O55137 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot1O55137 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Acot1O55137 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Acot1O55137 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot1O55137 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot1O55137 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot1O55137 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot1O55137 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Acot1O55137 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acot1O55137 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot1O55137 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot1O55137 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot1O55137 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot1O55137 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms