Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif6O55135 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif6O55135 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif6O55135 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eif6O55135 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif6O55135 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif6O55135 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif6O55135 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif6O55135 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif6O55135 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms