Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nipsnap1O55125 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms