Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk2O54967 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk2O54967 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk2O54967 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnk2O54967 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnk2O54967 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnk2O54967 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnk2O54967 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnk2O54967 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnk2O54967 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnk2O54967 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnk2O54967 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnk2O54967 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnk2O54967 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnk2O54967 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnk2O54967 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnk2O54967 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnk2O54967 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnk2O54967 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnk2O54967 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnk2O54967 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnk2O54967 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnk2O54967 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnk2O54967 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnk2O54967 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnk2O54967 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnk2O54967 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnk2O54967 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnk2O54967 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnk2O54967 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnk2O54967 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnk2O54967 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnk2O54967 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnk2O54967 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms