Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole2O54956 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole2O54956 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pole2O54956 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pole2O54956 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole2O54956 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms