Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NlkO54949 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NlkO54949 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NlkO54949 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NlkO54949 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NlkO54949 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NlkO54949 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NlkO54949 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NlkO54949 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NlkO54949 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NlkO54949 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NlkO54949 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NlkO54949 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NlkO54949 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NlkO54949 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NlkO54949 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NlkO54949 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NlkO54949 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NlkO54949 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NlkO54949 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NlkO54949 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NlkO54949 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NlkO54949 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NlkO54949 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NlkO54949 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NlkO54949 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NlkO54949 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NlkO54949 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NlkO54949 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NlkO54949 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NlkO54949 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NlkO54949 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NlkO54949 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NlkO54949 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NlkO54949 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NlkO54949 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NlkO54949 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NlkO54949 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NlkO54949 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NlkO54949 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NlkO54949 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NlkO54949 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NlkO54949 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NlkO54949 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NlkO54949 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NlkO54949 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NlkO54949 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NlkO54949 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NlkO54949 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NlkO54949 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NlkO54949 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NlkO54949 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NlkO54949 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NlkO54949 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NlkO54949 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NlkO54949 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NlkO54949 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NlkO54949 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NlkO54949 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NlkO54949 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NlkO54949 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NlkO54949 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NlkO54949 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NlkO54949 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NlkO54949 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NlkO54949 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NlkO54949 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NlkO54949 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NlkO54949 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NlkO54949 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NlkO54949 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NlkO54949 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NlkO54949 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NlkO54949 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms