Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cldn5O54942 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn5O54942 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn5O54942 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn5O54942 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn5O54942 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn5O54942 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn5O54942 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn5O54942 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn5O54942 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn5O54942 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn5O54942 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn5O54942 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn5O54942 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn5O54942 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn5O54942 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn5O54942 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn5O54942 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn5O54942 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn5O54942 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cldn5O54942 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn5O54942 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn5O54942 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms