Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NfkbieO54910 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NfkbieO54910 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NfkbieO54910 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NfkbieO54910 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NfkbieO54910 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfkbieO54910 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms