Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd200O54901 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd200O54901 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd200O54901 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd200O54901 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd200O54901 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd200O54901 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd200O54901 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms