Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Per1O35973 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Per1O35973 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Per1O35973 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Per1O35973 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Per1O35973 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Per1O35973 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Per1O35973 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Per1O35973 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Per1O35973 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Per1O35973 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Per1O35973 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Per1O35973 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Per1O35973 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Per1O35973 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Per1O35973 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Per1O35973 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Per1O35973 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Per1O35973 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Per1O35973 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Per1O35973 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Per1O35973 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Per1O35973 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Per1O35973 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Per1O35973 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Per1O35973 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Per1O35973 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Per1O35973 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Per1O35973 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Per1O35973 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Per1O35973 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Per1O35973 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Per1O35973 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Per1O35973 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Per1O35973 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Per1O35973 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Per1O35973 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Per1O35973 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Per1O35973 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Per1O35973 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Per1O35973 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Per1O35973 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Per1O35973 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Per1O35973 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Per1O35973 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Per1O35973 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Per1O35973 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Per1O35973 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Per1O35973 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Per1O35973 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Per1O35973 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Per1O35973 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Per1O35973 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Per1O35973 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Per1O35973 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Per1O35973 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Per1O35973 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Per1O35973 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Per1O35973 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Per1O35973 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Per1O35973 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Per1O35973 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Per1O35973 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Per1O35973 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Per1O35973 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Per1O35973 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Per1O35973 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Per1O35973 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Per1O35973 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Per1O35973 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Per1O35973 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Per1O35973 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Per1O35973 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Per1O35973 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Per1O35973 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Per1O35973 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Per1O35973 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Per1O35973 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Per1O35973 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Per1O35973 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Per1O35973 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Per1O35973 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Per1O35973 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Per1O35973 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Per1O35973 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Per1O35973 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Per1O35973 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Per1O35973 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Per1O35973 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Per1O35973 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Per1O35973 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Per1O35973 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Per1O35973 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Per1O35973 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Per1O35973 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Per1O35973 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Per1O35973 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Per1O35973 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Per1O35973 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Per1O35973 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms