Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CaluO35887 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CaluO35887 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CaluO35887 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CaluO35887 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CaluO35887 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CaluO35887 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CaluO35887 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CaluO35887 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CaluO35887 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CaluO35887 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CaluO35887 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CaluO35887 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CaluO35887 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CaluO35887 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CaluO35887 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CaluO35887 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CaluO35887 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CaluO35887 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CaluO35887 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CaluO35887 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CaluO35887 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CaluO35887 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CaluO35887 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CaluO35887 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CaluO35887 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CaluO35887 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CaluO35887 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CaluO35887 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CaluO35887 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CaluO35887 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CaluO35887 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CaluO35887 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CaluO35887 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CaluO35887 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CaluO35887 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CaluO35887 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CaluO35887 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CaluO35887 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CaluO35887 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CaluO35887 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CaluO35887 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CaluO35887 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CaluO35887 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CaluO35887 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CaluO35887 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CaluO35887 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CaluO35887 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CaluO35887 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CaluO35887 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CaluO35887 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CaluO35887 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CaluO35887 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CaluO35887 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CaluO35887 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CaluO35887 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CaluO35887 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CaluO35887 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CaluO35887 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CaluO35887 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CaluO35887 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CaluO35887 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CaluO35887 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CaluO35887 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CaluO35887 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CaluO35887 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CaluO35887 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CaluO35887 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CaluO35887 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CaluO35887 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CaluO35887 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CaluO35887 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CaluO35887 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CaluO35887 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CaluO35887 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CaluO35887 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CaluO35887 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CaluO35887 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CaluO35887 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CaluO35887 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CaluO35887 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CaluO35887 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CaluO35887 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CaluO35887 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CaluO35887 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CaluO35887 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CaluO35887 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CaluO35887 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CaluO35887 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CaluO35887 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CaluO35887 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CaluO35887 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CaluO35887 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CaluO35887 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CaluO35887 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CaluO35887 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CaluO35887 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CaluO35887 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CaluO35887 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CaluO35887 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms