Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc1a6O35544 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc1a6O35544 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc1a6O35544 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc1a6O35544 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc1a6O35544 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc1a6O35544 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc1a6O35544 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc1a6O35544 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc1a6O35544 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc1a6O35544 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc1a6O35544 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc1a6O35544 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc1a6O35544 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms