Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx1aO35526 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms