Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Foxd2O35392 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Foxd2O35392 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms