Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih1O35372 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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