Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st1O35310 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hs3st1O35310 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms