Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms