Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf11O35235 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms