Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx3O35160 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms