Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q1O19441 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms