Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casq1O09165 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casq1O09165 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casq1O09165 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casq1O09165 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casq1O09165 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casq1O09165 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Casq1O09165 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casq1O09165 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casq1O09165 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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