Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eftud2O08810 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms