Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ube3aO08759 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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