Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec22bO08547 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec22bO08547 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms