Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8050L7N2E3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms