Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17577J3QNF7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17577J3QNF7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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