Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf4bG5E8Z2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf4bG5E8Z2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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