Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sclt1G5E861 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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