Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp32F8VPZ3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp32F8VPZ3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms