Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28038F7BCN9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28038F7BCN9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28038F7BCN9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28038F7BCN9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28038F7BCN9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28038F7BCN9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28038F7BCN9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28038F7BCN9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28038F7BCN9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms