Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms