Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sptbn5F6UCX4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms