Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M11F6U8V3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M11F6U8V3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms