Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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BC067074F6RXI4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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BC067074F6RXI4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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BC067074F6RXI4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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BC067074F6RXI4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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BC067074F6RXI4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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BC067074F6RXI4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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BC067074F6RXI4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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BC067074F6RXI4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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BC067074F6RXI4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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BC067074F6RXI4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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BC067074F6RXI4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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BC067074F6RXI4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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BC067074F6RXI4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC067074F6RXI4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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