Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd7E9Q9W7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd7E9Q9W7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms