Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcmdc2E9Q956 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mcmdc2E9Q956 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcmdc2E9Q956 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms