Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Gm5407E9Q7Q1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Gm5407E9Q7Q1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gm5407E9Q7Q1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gm5407E9Q7Q1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Gm5407E9Q7Q1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Gm5407E9Q7Q1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Gm5407E9Q7Q1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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Gm5407E9Q7Q1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Gm5407E9Q7Q1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gm5407E9Q7Q1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gm5407E9Q7Q1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Gm5407E9Q7Q1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Gm5407E9Q7Q1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Gm5407E9Q7Q1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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