Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Simc1E9Q6E9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Simc1E9Q6E9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms