Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms