Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb9E9Q5G2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb9E9Q5G2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms