Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BC005561E9Q5E2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BC005561E9Q5E2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BC005561E9Q5E2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms