Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930579F01RikE9Q3L6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms