Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms