Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3893E9Q1I1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3893E9Q1I1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3893E9Q1I1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3893E9Q1I1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3893E9Q1I1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3893E9Q1I1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3893E9Q1I1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3893E9Q1I1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3893E9Q1I1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3893E9Q1I1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3893E9Q1I1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
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