Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm3095E9Q058 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3095E9Q058 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms